機電工程與自動化學院由原國防科學技術大學自動控制系、機械電子工程與儀器系于1999年10月合并組建，下設自動控制系、儀器科學與技術系、機電工程系、機電工程研究所和自動化研究所。學院擁有一支高水平的教師隊伍。在這支隊伍中，既有在學術界影響較大的老專家，又有一批嶄露頭角的青年學術骨干。其中，國務院學位委員會委員1人，國務院學科評議組成員2人（第六屆）、1人被評為全國教學名師、1人被聘為“長江學者”特聘教授；3人被評為國家“有突出貢獻的中青年專家”，1人入選新世紀百千萬人才工程國家級人員、1人獲得國家杰出青年基金獎、4人入選教育部新世紀優秀人才支持計劃；約有60%的教師具有副高以上專業技術職稱，73%的教師獲得了博士學位；有13人享受國務院特殊津貼。目前，學院在崗博士生導師31人，碩士生導師86人。計算機硬件技術與控制系列課程教學團隊被評為國家級教學團隊。近30年來，學院獲得國家、行業和部委級教學與科研成果獎200余項，其中獲國家科技進步一等獎2項、二等獎4項、三等獎2項，國家發明獎5項，國家級教學成果二等獎1項，另有90余項教學科研成果獲部委級二等獎以上獎勵。學院已通過GB/T19001:2000和GJB9001A-2001質量管理體系認證。學院科研共分七個主要研究領域： 1.智能機器人系統領域。主要開展地面移動機器人系統、智能機器人環境感知、任務規劃與控制、無人機系統自主控制以及仿生機器人技術等研究。 2.導航制導與控制技術。主要開展先進制導技術、慣性技術和自主導航定位技術等研究。 3.精密工程與微機電領域。主要開展超精密加工技術、納米精度檢測技術和微機電系統技術等研究。 4.監控診斷與可靠性領域。主要開展機器狀態監控與故障診斷、測試性設計與評估、可靠性試驗與理論技術、裝備維修保障技術等方面研究。 5.仿真技術領域。主要開展仿真基礎理論與方法、仿真支撐技術和仿真應用技術等方面研究 6.空間測控儀器工程領域。主要開展無線電測量、光學測量和數字化測試等技術等研究。 7.磁懸浮控制技術領域。主要開展磁懸浮列車懸浮、直線牽引和運行的控制，以及磁懸浮系統設計與集成等研究。