中國農業機械化科學研究院呼和浩特分院有限公司前身是機械工業部呼和浩特畜牧機械研究所，成立于1960年。1998年11月整建制并入中國農業機械化科學研究院，1999年轉制為中央直屬科技型企業。呼和浩特分院是從事畜牧業裝備技術研究與產品開發并具有自營進出口權的專業科研機構，也是較早從事風能、太陽能利用技術研究的科研單位之一。分院是全國畜牧機械行業技術歸口單位，是國家草原畜牧業裝備工程技術研究中心、國家地方聯合太陽能干燥技術工程實驗室、全國風力機械標準化技術委員會、全國農業機械標準化技術委員會畜牧機械分技術委員會、中國農業機械學會畜牧機械學會和機械工業畜牧機械產品質量監督檢測中心、風力機械產品質量監督檢測中心的掛靠單位，其中國家草原畜牧業裝備工程技術研究中心已經成為我國草原畜牧業裝備行業工程化集成化技術源頭、工程化科研成果試驗測試基地和中試基地、高水平工程化人才培養基地及科研成果工程化信息服務中心。分院現有從業人員580人，其中各類專業技術人員150人，專業技術人員中高中級專業技術人員77人，其中研究員12人，獲國家特殊津貼專家3人。截止2019年分院共完成科研技術開發項目1052項，擁有專利140項；絕大部分在生產中得到推廣應用，其中獲國家級、省部級等科技成果獎123項，為國民經濟建設和畜牧業機械化做出了突出貢獻。進入“十三五”以來，我院共承擔國家和地方重點科技項目（課題）47項。